吉非替尼最突显的不良反应是腹疼和拉肚子，及其疹子和皮肤发痒。腹疼和拉肚子大多数产生在进餐或饮水后1~2钟头，与进餐的容积和溫度有关；容积越大，溫度越低，越易产生。
腹疼一般为小肚子扭痛，可觉得到肠道迅速地肠蠕动，进而肛门口有急坠和“缺堤”之感，这时候假如上厕所，则放射形排出来水样便，如浓稠的面糊糊，以后就舒服。那样的腹痛腹胀，有时候几日一次，有时候一天一次，有时候一天几次，几近没有规律性可循；假如餐前服食中药方剂腹可安片，一般可清除那样的腹痛腹胀。假如一天只腹痛腹胀3次下列，不用尤其解决；频次多了，才可断药1~2天，随后再次服药。这般腹痛腹胀，在全部靶向药物中，吉非替尼是较与众不同的。
吉非替尼另一明显的不良反应是肌肤问题，面部或后背等处会生长疹子，但远沒有吃易瑞沙的看起来繁茂、聚集和大规模。较反感的是有时候会皮肤发痒，特别是在小腿骨的皮上，禁不住抓烂了就结疤，十分不好看。除此之外，牙龈肿痛、舌头溃疡、咽喉痛……诸多容易上火状况，也是吉非替尼的不良反应。也有一种难除的却又可操纵的不良反应，便是手指甲沟炎，立即剪去嵌进肉里的 指甲，用上抑菌消炎的药，温度高的情况下尽可能不穿闷汗的鞋，就能应对。
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